Читать книгу Informatics and Machine Learning. From Martingales to Metaheuristics онлайн

100 страница из 101

9 3.9 Using the code examples with stops used to mark boundaries, identify long ORF regions in the E. coli genome (the one described in (Exercise 3.7)). Produce an ORF length histogram like that shown in ssss1.

10 3.10 Create an overlap‐encoding topology scoring method (like that described for ssss1), and use it to obtain topology histograms like those shown in ssss1a and ssss1. Do this for the following genomes: E. coli (K‐12 strain); V. cholera; and Deinococcus Radiodurans.

11 3.11 In a highly trusted coding region, such as the top 10% of the longest ORFs in the E. coli genome analysis, perform a gap IMM analysis, which should approximately reproduce the result shown in ssss1.

12 3.12 Prove that relative entropy is always positive.

Конец ознакомительного фрагмента.

Текст предоставлен ООО «ЛитРес».

Прочитайте эту книгу целиком, купив полную легальную версию на ЛитРес.

Безопасно оплатить книгу можно банковской картой Visa, MasterCard, Maestro, со счета мобильного телефона, с платежного терминала, в салоне МТС или Связной, через PayPal, WebMoney, Яндекс.Деньги, QIWI Кошелек, бонусными картами или другим удобным Вам способом.

Правообладателям