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También es importante mencionar que, aunque exista un marco jurídico debidamente legislado en asuntos mercantiles o de colaboraciones entre empresas, cada entidad puede aportar a la negociación un “escenario o marco propio”, unas condiciones determinadas de entender la relación, en donde se pueden llegar a ver cláusulas que son motivo de rechazo directo por alguna de las partes, o de insatisfacción permanente durante la redacción del acuerdo.

Existen numerosos casos de fracaso a la hora de discutir un acuerdo de colaboración. La manera de gestionar los acuerdos por parte de algunas empresas a veces no coincide con los acuerdos que se gestionan desde las instituciones públicas. Todo debe de ponerse en contexto, pero muchas empresas ofrecen su propio marco legal como prácticamente inamovible para la otra parte.

Incidiendo aún más en el posible fracaso del acuerdo, cabe aclarar que podemos encontramos ante un acuerdo que, tras su firma creamos que hemos alcanzado un acuerdo satisfactorio y, con el tiempo, darnos cuenta de que lo que se firmó en su día, hoy ya no lo encontramos satisfactorio para los intereses de la institución o, cuanto menos, del equipo investigador que lidera el proyecto. Es entonces cuando podemos hablar de una relación desigual o descompensada.